나노코박스 백신의 유효성은 다른 백신과 마찬가지로 시간 경과에 따라 감소한다. 구체적으로 42~90일 후에는 86.7%, 120일 후에는 78.5%, 180일 후에는 51.6%로 감소한다.

이 백신은 환자를 사망으로부터 보호하는 효과가 100%, 중증 예방 효과가 92%에 달한다. 전체 시간으로 보면 25mcg의 튜여량으로 52.1%의 유효성을 갖는다. 이는 세계보건기구와 미국 식품의약국의 유통 허가 기준을 충족한다.