In der zweiten Abstimmung erhielt er 99 Stimmen und erreichte damit die erforderliche Mehrheit.

In seiner Antrittsrede im Parlament betonte er, dass mit diesem Ereignis eine neue Phase in der Geschichte des Libanon begonnen habe. Der Libanon werde in die Armee investieren, um die Grenzen zu sichern, den Terrorismus bekämpfen, internationale Resolutionen umsetzen und israelische Angriffe verhindern, sagte der Präsident. Es werde keine Immunität für Kriminelle und Korruption geben, so Aoun weiter. 
Aoun übernahm 2017 das Kommando über die Armee. In dieser Position ist er derzeit auch dafür zuständig, die im November vereinbarte Waffenruhe zwischen der proiranischen Hisbollah-Miliz und Israel zu überwachen.