สภาตรวจสอบโครงการเป้าหมายแห่งชาติเกี่ยวกับการพัฒนาเศรษฐกิจสังคมในเขตเขาและเขตชนกลุ่มน้อยระยะปี 2021-2030 มีหน้าที่ตรวจสอบและประเมินรายงานเกี่ยวกับโครงการฯเพื่อยื่นเสนอให้รัฐบาลพิจารณาอนุมัติ เรียกร้องให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้องจัดสรรเอกสารและข้อมูลเพื่อทำการตรวจสอบและประเมิน รวมทั้งทำการปรับปรุงและแก้ไขเอกสารถ้าจำเป็น ตลอดจนพิจารณาอนุมัติแผนการตรวจสอบและปัญหาอื่นๆ.