อังกฤษและอียูจะเข้าสู่ระยะเปลี่ยนผ่านจนถึงสิ้นปี 2020 เพื่อเจรจาเกี่ยวกับความสัมพันธ์ในอนาคต ซึ่งในช่วงเวลานี้ อังกฤษจะได้รับสิทธิผลประโยชน์และต้องปฏิบัติหน้าที่เช่นเดียวกับประเทศสมาชิกอียู

สิ่งที่ประชามติให้ความสนใจคือการที่อังกฤษและอียูจะสามารถเสร็จสิ้นการเจรจาและอนุมัติข้อตกลงเกี่ยวกับความสัมพันธ์ในอนาคตได้หรือไม่ ซึ่งข้อตกลงดังกล่าวต้องครอบคลุมด้านต่างๆ เช่น การแลกเปลี่ยนสินค้า สิทธิเสรีภาพในการเดินทาง สิทธิของผู้ใช้แรงงาน การอนุรักษ์สิ่งแวดล้อมและปัญหาความมั่นคง แต่ทั้ง 2 ฝ่ายยังมีความขัดแย้งเกี่ยวกับปัญหาต่างๆ เช่น การจับปลาในเขตทะเลของอังกฤษ การเข้าถึงตลาดการเงินของอียูและมาตรฐานเกี่ยวกับเงินอุดหนุนจากรัฐ โดยในการประชุมกับนาย บอริส จอห์นสัน  นายกรัฐมนตรีอังกฤษเมื่อวันที่ 8 มกราคม นาง Ursula von der Leyen ประธานคณะกรรมการยุโรปได้เตือนว่า การเจรจาข้อตกลงด้านการค้าจะมีความลำบากกว่าการเจรจาเกี่ยวกับกระบวนการ Brexit.