Dari 30 cagar biosfer baru yang diakui UNESCO, Raja Ampat dianggap sebagai ekosistem laut dengan keanekaragaman hayati tertinggi di Bumi.
Cagar Biosfer Raja Ampat mencakup wilayah seluas sekitar 135.000 km² dengan lebih dari 610 pulau, namun hanya 34 pulau yang berpenghuni. Terletak di jantungnya Segitiga Terumbu Karang, kawasan ini memiliki ekosistem terumbu karang terkaya di dunia, dengan lebih dari 75% spesies karang dunia, lebih dari 1.320 spesies terumbu karang, beserta 5 spesies penyu laut langka dan terancam punah.
