การเปิดใช้ระบบ EES หมายความว่า ผู้ที่ไม่ใช่พลเมืองสหภาพยุโรปจะต้องลงทะเบียนข้อมูลไบโอเมตริกซ์ ลายนิ้วมือและรูปถ่ายเมื่อเข้าเขตเชงเกนเป็นครั้งแรก และหลังจากนั้นในการเดินทางเข้าออกเมืองครั้งต่อๆ ไป จะใช้เพียงการระบุตัวตนด้วยไบโอเมตริกซ์เท่านั้น สนามบินสำคัญๆ ในอิตาลี รวมถึง ฟิอูมิชิโนและมัลเปนซา ตลอดจน ท่าเรือเจนัวและชีวีตาเวกเกีย เริ่มใช้ระบบใหม่นี้เมื่อวันที่ 12 ตุลาคม ในขณะที่เยอรมนีเริ่มทยอยเปิดใช้ระบบนี้ในเมืองสตุทท์การ์ท ระบบจะทยอยเริ่มใช้งานในช่วงระยะเวลาเปลี่ยนผ่านเป็นเวลา 6 เดือน ก่อนที่จะมีการใช้งานอย่างเต็มรูปแบบในทุกประเทศสมาชิกอียูในวันที่ 10 เมษายนปี 2026เป็นต้นไป

ระบบนี้จะถูกเปิดใช้งานในทุกประเทศสมาชิกอียู ยกเว้นไอร์แลนด์และไซปรัส รวมถึง 4 ประเทศนอกอียูได้แก่ ไอซ์แลนด์ นอร์เวย์ สวิตเซอร์แลนด์และลิกเตนสไตน์  .